Fizyoterapi süreci genellikle kapsamlı bir ilk değerlendirme ile başlar. Fizyoterapist, bireyin tıbbi geçmişini, mevcut şikayetlerini, ağrı düzeyini, hareket açıklığını, kas gücünü ve fonksiyonel becerilerini detaylı bir şekilde inceler. Bu değerlendirme sonucunda, bireyin durumuna özel bir tedavi planı oluşturulur. Tedavi planı; manuel terapi teknikleri (masaj, mobilizasyon, manipülasyon), egzersiz tedavisi (kuvvetlendirme, esneklik, denge egzersizleri), elektroterapi (TENS, ultrason), sıcak/soğuk uygulamalar ve bantlama gibi çeşitli yöntemleri içerebilir.
Seanslar genellikle birebir olarak gerçekleştirilir ve terapist, bireyin ilerlemesini yakından takip eder, tedavi planını gerektiğinde günceller. Süreç, rahatsızlığın türüne ve ciddiyetine bağlı olarak birkaç haftadan aylara kadar değişebilir. Örneğin, basit bir kas gerilmesi birkaç seansla düzelebilirken, ameliyat sonrası rehabilitasyon veya kronik bir nörolojik durum daha uzun süreli bir tedavi gerektirebilir. Her seans sonunda, fizyoterapist genellikle evde uygulanabilecek egzersizler ve yaşam tarzı önerileri sunarak iyileşme sürecini destekler ve bireyin kendi kendine yönetim becerilerini geliştirir.